Colección Microbioma de Plantas

La Colección Microbioma de Plantas es un Servicio Científico Técnico creado en 2020 que tiene como objetivo la conservación, identificación y valorización de los recursos microbianos (hongos y bacterias) obtenidos por varios grupos de investigación del IRNASA-CSIC.

La Colección del Microbioma de Plantas surge con el objetivo de consolidar las colecciones de microorganismos endófitos del IRNASA-CSIC. Durante las dos últimas décadas varios grupos de investigación se han dedicado al estudio de la diversidad biológica y función de microorganismos no patógenos asociados a plantas, principalmente hongos y bacterias, dando lugar a varias colecciones de microorganismos. Actualmente estamos trabajando en tareas de conservación, clasificación e identificación de los recursos existentes.

Otro de los objetivos es crear una plataforma que permita la valorización de la colección de microorganismos endófitos desde un punto de vista científico e industrial.

Durante el año 2021 se ha trabajado en la agrupación, catalogación y almacenamiento de diversas colecciones de hongos. Actualmente hay 1583 aislados de hongos conservados en criogenia y catalogados, 700 de ellos identificados con secuencias de rDNA.

1583 aislados de hongos

conservados en criogenia
y catalogados

700 hongos identificados

con secuencias de rDNA

La Colección Microbioma de Plantas:

  • Forma parte de las colecciones REDESMI (Red Española de Microorganismos)

    REDESMI. Red Española de Microorganismos

  • Está registrada en las Colecciones del CSIC.

  • Está incorporada a la plataforma PTI-ECOBIODIV+ Plataforma Temática Interdisciplinar para la síntesis de datos de Ecología y Biodiversidad, que tiene como objetivo la integración de datos de biodiversidad y ambientales en una plataforma en abierto.

Infraestructura:

Este servicio fue equipado a través de la convocatoria de infraestructura del Subprograma Estatal de Infraestructuras de Investigación y Equipamiento Científico-Técnico (Referencia EQC2019-005990-P), que se ejecutó durante el período 2020-21 con la adquisición de los siguientes equipos:

  • Sistema de electroforesis automática de alta resolución para ácidos nucleicos y proteínas.

  • Homogeneizador para uso por vía seca, húmeda y criogénica de pequeños volúmenes de muestra.

  • Sistema de codificación de muestras para almacenamiento.

  • Dos ultracongeladores verticales de −86°C.

  • Liofilizador.

  • Termociclador DNA.

  • Micro-centrífuga refrigerada.

  • Cabina PCR.

  • Dos cabinas de flujo laminar de seguridad biológica.

  • Estufas de incubación.

Actualmente se ofrecen los siguientes servicios a usuarios internos y externos:

  • Análisis de calidad de RNA mediante electroforesis automática de alta resolución.

  • Análisis de calidad y cuantificación de DNA mediante electroforesis automática de alta resolución.

  • Identificación de cultivos de hongos por medio de secuenciación de rDNA.

  • Caracterización de aislados de hongos: Solubilización de fosfato (Pikovskaya).

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